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- 通年
- バイオスーパーコンピューティング特論（修士課程・必修・４単位）
- 隔週通年
- 基礎ゼミ（１年生・必修・少人数講義・１単位）
- 専門ゼミ（２年生・必修・少人数講義・１単位）
- 前期
- 情報総合実習（２年生・必修・１単位）
- 制御工学（３年生・必修・医用工学科・２単位）
- 生命情報工学総論（１年生・必修・分担・２単位）
- 生命情報工学演習１（３年生・必修・少人数講義・１単位）
- システム生命科学応用演習（４年生・必修・少人数講義・１単位）
- 生体システム工学基礎（修士課程・必修・分担・２単位）
- 医療・暮らし・科学（一般教養・選択・分担・２単位）
- 後期
- 線形代数学（１年生・必修・２単位）
- プログラミング基礎実習（１年生・必修・１単位）
- 情報基礎実験（２コマ・２年生・必修・実験３：並列コンピューティング・２単位）
- 生命情報工学演習２（２コマ・３年生・必修・少人数講義・２単位）
- 生命情報工学講究１（２年生・必修・分担・２単位）
- 専門領域実践英語I (修士課程・必修・２単位）
- 医療・暮らし・科学（一般教養・選択・分担・２単位）
- その他
- 卒業研究（６単位）
- 特別研究１（６単位）
- 特別研究２（６単位）
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