Activity FY2022
Papers, Talks, and Posters
FY2022
（学会発表・ポスター）「Deep Neural Networkを用いたレプリカ温度調整法の開発」,中条貴裕,斎藤聖奈,松倉里紗,宮下尚之,日本物理学会2023年春季大会, オンライン開催, 3/22-25, 2023
（学会発表・口頭）「共有結合型ペプチド薬剤とGST二量体との相互作用機構」,松倉里紗, 瀧真清, 宮下尚之, 渡辺信一, Jay Yang, 日本物理学会2023年春季大会, オンライン開催, 3/22-25, 2023
（学会発表・口頭）「DNNベースのタンパク質モーフィング手法を用いたモノアミン酸化酵素のダイナミクス解析」, 清岡亮太, 大多和克紀, 松倉里紗, 宮下尚之, 日本物理学会2023年春季大会, オンライン開催, 3/22-25, 2023
(学会発表・ポスター)「HPCを用いたアルツハイマー病関連タンパク質γ切断酵素とコレステロールとの相互作用」, 南知香, 宮下尚之, 超異分野学会東京大会2023, 九段会館テラスコンファレンス＆バケット（東京）, 3/3-4, 2023
(国際学会・ポスター)『MOLECULAR DYNAMICS STUDY OF THE MECHANISM OF THE CLIENT UNFOLDED PROTEIN DELIVERY FROM HSP40 TO HSP70』, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, Biophysical Society Annual Meeting BPS2023, San Diego (USA), 2/18-22, 2023
(学会発表・ポスター)「γ切断酵素と APP の結合過程におけるコレステロールの役割」, 南知香, 松倉里紗, 宮下尚之, 第36回分子シミュレーション討論会, オンライン, 12/5~12/7, 2022
（学会発表・ポスター）「Deep Neural Network を用いた形からアミノ酸配列提案するプログラムの並列学習器モデルの考察」，岩野和哉，清岡亮太，宮下尚之，第36回分子シミュレーション討論会，オンライン開催，12/5-7, 2022
（招待講演・ポスター）「分子動力学シミュレーションを用いたHSPシャペロンサイクルの解明と新規薬剤の作用機構」, 松倉里紗, 宮下尚之, ISSP Women's week 2022 物性女性若手研究交流会, 東京大学物性研究所, 11/15, 2022
（学会発表・ポスター）「Molecular dynamics study of the interaction between a GST dimer and a novel peptidic covalent aptamer」, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, Masumi Taki, Shinichi Watanabe, Jay Yang, CBI学会2022年大会, タワーホール船堀, 10/25-27, 2022
（学会発表・ポスター）「Simulation study of the interaction between lipids and the complex structure of γ-secretase and APP or Notch. 」, Chika Minami, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, CBI学会2022年大会, タワーホール船堀, 10/25-27, 2022
（学会発表・ポスター)「Deep Neural Networkを用いたタンパク質アミノ酸変異部位の提案プログラムの開発」，岩野和哉，宮下尚之，近畿大学大学院サイエンスネットワーク2022・第10回院生サミット，近畿大学，10/1, 2022
（学会発表・ポスター）「Simulation study of the dissociation mechanism of the PPRP with RNA」, Sumile Tanaka, Lisa Matsukura, Masaki Ottawa, Naoyuki Miyashita, 第60回日本生物物理学会, 函館アリーナ・函館市民会館, 9/28-30, 2022
（学会発表・ポスター）「Application of the Protein Morphing Method and the Semi-automatic Simplified Path Exploration to the Membrane Protein Dimers Dynamics」, Ryota Kiyooka, Masaki Ottawa, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 第60回日本生物物理学会, 函館アリーナ・函館市民会館, 9/28-30, 2022
（学会発表・ポスター）「HSP40 binding affects the stability of HSP70」, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 第60回日本生物物理学会, 函館アリーナ・函館市民会館, 9/28-30, 2022
（学会発表・ポスター）「Coarse-grained model Simulation study of the docking process of γ-secretase and APP/ Notch」, Chika Minami, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 第60回日本生物物理学会, 函館アリーナ・函館市民会館, 9/28-30, 2022
（学会発表・ポスター）「Deep Neural Networkを用いたタンパク質の構造データからアミノ酸配列を提案するプログラムの開発」，岩野和哉，清岡亮太，宮下尚之，日本物理学会2022年秋季大会，東京工業大学，9/12-15, 2022
（学会発表・口頭）「反応座標上の構造変化経路探索にレプリカ交換法を組み込んだタンパク質の構造変化モーフィング手法 」, 清岡亮太, 松倉里紗, 宮下尚之，日本物理学会2022年秋季大会，東京工業大学，9/12-15, 2022
（学会発表・口頭）「アミロイド前駆体タンパク質と Notch 受容体の膜貫通部位とγ-切断酵素との相互作用とコレステロールとの関わり」, 南 知香, 松倉里紗, 宮下尚之，日本物理学会2022年秋季大会，東京工業大学，9/12-15, 2022
（学会発表・ポスター）「ペプチド型共有結合薬剤とGSTタンパク質との結合構造に関する分子動力学シミュレーション 」, 松倉里紗, 瀧真清，宮下尚之，渡辺信一，日本物理学会2022年秋季大会，東京工業大学，9/12-15, 2022