Activity

Papers, Talks, and Posters

FY2026

• 1. （国内発表・ポスター）”Conformational Changes of Adenylate Kinase Considering Ligand Effects by All-Atom AI Nonlinear Morphing Method: MOVE-DM3.0 ” ,樫山佳広, 平澤理音, 宮下尚之*, 第26回蛋白質科学会,6.17-19(2026), とりぎん文化会館 (鳥取市)

  2. （国内発表・ポスター）”Analysis of the Dynamics and Stability of the Terminal Regions in Double-Filament TMEM106B Fibrils: A Molecular Dynamics Simulation Study ” ,松本七海, 田所良崇, 宮下尚之*, 第26回蛋白質科学会,6.17-19(2026), とりぎん文化会館 (鳥取市)

  3. （国内発表・ポスター）”Coarse-Grained Molecular Dynamics Simulation for Elucidating the Mechanisms of Plasma Leakage and Albumin Deficiency in ECMO Hollow Fiber Membranes ” ,芝﨑亮汰, 福田誠, 宮下尚之*, 第26回蛋白質科学会,6.17-19(2026), とりぎん文化会館 (鳥取市)

  4. （国内発表・ポスター）”Transformerと機械学習を用いたタンパク質の非線形モーフィングから特徴的な動きをするアミノ酸を特定する時系列解析手法の開発 ” 平澤理音, 樫山佳広, 下河内翔太, 塩田優真, 宮下尚之*, 第26回蛋白質科学会,6.17-19(2026), とりぎん文化会館 (鳥取市)

  5. （国内発表・ポスター）”粗視化モデル分子動力学シミュレーションと機械学習を用いた膜貫通領域の二量体構造提案プロトコルの開発とEGFRの膜貫通領域二量体への応用” 津田晃達, 樫山佳広, 殿垣内尚杜, 宮下尚之*, 第26回蛋白質科学会,6.17-19(2026), とりぎん文化会館 (鳥取市)

  6. 予定（国際発表・ポスター）”Coarse-Grained Model Molecular Dynamics Simulation of Albumin-Involving Plasma Leakage and O2-CO2 exchange Dynamics in ECMO Hollow Fiber Membranes ” ,芝﨑亮汰, 福田誠, 宮下尚之*, 第64回生物物理学会年会,11.23-28(2026), BEXCO国際会議場(釜山)

  7. 予定（国際発表・ポスター）”AI-Based Non-Linear Morphing for All-Atom Protein-Ligand Conformational Changes: Application to Adenylate Kinase Dynamics ” ,樫山佳広, 平澤理音, 下河内翔太, 清岡亮太, 宮下尚之*, 第64回生物物理学会年会,11.23-28(2026), BEXCO国際会議場(釜山)

  8. 予定（国際発表・ポスター）”Structural Stability of Transmembrane Protein 106B (TMEM106B) Fibrils and Their Interactions with PET Tracers ” ,松本七海, 宮下尚之*, 第64回生物物理学会年会,11.23-28(2026), BEXCO国際会議場(釜山)

  9. 予定（国際発表・ポスター）”Machine-Larning and Transformer-Based MD Trajectory Analysis for Conformational Changes: Application to Adenylate Kinase Open-Close Motions ” ,平澤理音, 樫山佳広, 下河内翔太, 塩田優真, 宮下尚之*, 第64回生物物理学会年会,11.23-28(2026), BEXCO国際会議場(釜山)

  10. 予定（国内発表・口頭）”Dynamic Analysis of Monoamine Oxidase B Dimer Using the Transformer- and Machine Learning-Based MD Trajectory Analysis Method, DeKE-MD2.0 ” ,平澤理音,  鈴川祐生, 樫山佳広, 下河内翔太, 塩田優真, 田所良祟, 大多和克紀, 宮下尚之*, 第80回日本物理学会, 9.14-17(2026), 東京大学駒場キャンパス (東京都)

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  12. （国内発表・ポスター）『タイトル』, 著者全員, 学会名, 日付, 場所