Lisa Matsukura

がん病関連タンパク質のシミュレーションと新規中分子薬剤の研究、解析ソフトの開発

参加・発表など活動内容

• 2021年度

  • 予定（国内学会）「The stability of HSP90NTD and ch-chaperone p23 by the domain swapping in HSP90 dimer」,
    ◯Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 第21回日本蛋白質科学会年会, オンライン開催, 2021/6/16-18

• 2020年度

  • 予定（国内学会）「The effect of the interaction between HSP90 and co-chaperone by novel HSP90 inhibitor」,
    ◯Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 日本物理学会第76回年次大会(2021年), オンライン開催, 2021/3/12-15

  • 予定（国内学会）「生体膜中におけるAPPとα-/β-切断酵素との相互作用機構」,
    柳野賀緒梨，大多和克紀，松倉里紗，◯宮下尚之，日本物理学会第76回年次大会(2021年), オンライン開催, 2021/3/12-15

  • 予定（国内学会）「モノアミン酸化酵素B(MAO-B)の薬剤結合部位のダイナミクスとPETトレーサーの結合」,
    ◯大多和克紀, 松倉里紗, 宮下尚之, 原田龍一, 木村裕一, 古本祥三,  日本物理学会第76回年次大会(2021年), オンライン開催, 2021/3/12-15

  • 予定（国際学会）「DETAIL DYNAMICS AFTER ATP BINDING IN HSP90 CHAPERONE CYCLE AND THE EFFECT OF NOVEL PEPTIDE DRUG CANDIDATE USING MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS」,
    ◯Lisa Matsukura，Naoyuki Miyashita*，65th Biophysical Society Annual Meeting BPS2021，オンライン開催，2021/2/22-26

  • （国内学会）「分子シミュレーションを用いたHSP90機能阻害薬の作用機構の解明」,
    ◯松倉里紗，宮下尚之*，瀧真清，第34回分子シミュレーション討論会，オンライン開催，2020/12/15

  • （国内学会）「MAO-Bのリガンド結合部の動力学とPET薬剤の結合自由エネルギー計算」,
    ◯大多和克紀, 松倉里紗, 宮下尚之, 原田龍一, 木村裕一, 古本祥三, 第34回分子シミュレーション討論会, オンライン開催, 2020/12/15

  • （国内学会）「HSP90-NTD二量体におけるドメインスワッピングの機能」,
    ◯松倉里紗，瀧真清，渡辺信一，宮下尚之*，第43回日本分子生物学会年会，オンライン開催，2020/12/2-4

  • （国内学会）「PETトレーサーとMAO-B/タンパク質との薬剤結合」,
    ◯大多和克紀, 田中良奈, 松倉里紗, 宮下尚之, 原田龍一, 木村裕一, 古本祥三,  第43回日本分子生物学会年会, オンライン開催, 2020/12/2-4

  • （国際論文）「Moderately-rigid and enthalpy-contributed cryptand-like library on bacteriophage T7: Design and selection of strong binder for cancer-related protein (Hsp90)」, Kazuto Mochizuki+, Lisa Matsukura+, Yuji Ito, Naoyuki Miyashita*, and Masumi Taki*, Organic & Biomolecular Chemistry, 19, 146-150, 2021, (+ : equiv contribution)

  • （国内学会・招待講演・シンポジウム）「New Peptide Drug and the Molecular Dynamics Simulations of Target Protein and the New Drug .」,
    ◯Lisa Matsukura，Naoyuki Miyashita*，Masumi Taki，Shinichi Watanabe, 第58回日本生物物理学会年会, オンライン開催, 2020/9/16-18

  • （国内学会）「The dynamics of dopamine-regulated protein MAO-B in the mitochondrial membrane 」,
    ◯MasakiOttawa, LisaMatsukura, NaoyukiMiyashita*, RyuichiHarada, YuichiKimura, SyozoFurumoto, 第58回日本生物物理学会年会, オンライン開催, 2020/9/16-18

  • （国内学会）「HSP90二量体のシミュレーションと新規薬剤との相互作用１」,
    ◯松倉里紗，宮下尚之*，瀧真清，渡辺信一，日本物理学会2020年秋季大会，オンライン開催，2020/9/8-11

  • （国内学会）「生体膜環境下におけるMAO-Bの長時間分子動力学シミュレーションと薬剤結合」，
    ○大多和克紀，松倉里紗，柳野賀緒梨，宮下尚之*，原田龍一，木村裕一，古本祥三，日本物理学会2020年秋季大会，オンライン開催，2020/9/8-11

  • （国内学会）「Molecular Dynamics Simulation of HSP90 Dimer and Docking Simulation of the Peptide Drug」,
    ◯Lisa Matsukura，Naoyuki Miyashita*，Masumi Taki，Shinichi Watanabe, 第20回日本蛋白質科学会年会, オンライン開催, 2020/7/7-9

  • （国内学会）「Molecular Dynamics Simulations of Monoamine Oxidase B (MAO-B) and the drug binding」,
    ◯Masaki Ottawa, Lisa Matsukura, Kaori Yanagino, Naoyuki Miyashita, Ryuichi Harada, Yuichi Kimura, Syozo Furumoto, 第20回日本蛋白質科学会年会, オンライン開催, 2020/7/7-9

• 2019年度

  • （大学院部長賞受賞🎉）近畿大学卒業式・学位授与式，近畿大学大学院部長賞受賞，松倉 里紗, 2020/3/18

  • （国内学会）「ドッキングシミュレーションを用いたHSP90と中分子薬の結合機構」,
    ◯松倉里紗，望月和人，宮下尚之*，瀧真清，渡辺信一, 第75回日本物理学会(2020年)年次大会, オンライン開催,  2020/3/16-19

  • （国内学会）「粗視化モデルシミュレーションを用いたチロシンキナーゼの膜貫通部位のラフト中の二量体形成」,
    ◯井本誓龍，南知香，柳野賀緒梨，松倉里紗，宮下尚之*, 第75回日本物理学会(2020年)年次大会, オンライン開催,  2020/3/16-19

  • （国内学会）「学習データの自動選択法を取り入れたDeep Learningによる水溶液中タンパク質のホモロジーモデリング手法の開発」,
    ◯古江 祐也，松倉里紗，大多和克紀, 宮下尚之*, 第75回日本物理学会(2020年)年次大会, オンライン開催, 2020/3/16-19

  • （国内学会）「MAO-Bの長時間分子動力学シミュレーションによる薬剤結合部位の動力学解析」,
    ◯大多和克紀，松倉里紗，田中良奈，柳野賀緒梨，宮下尚之*，木村裕一，古本祥三, 第75回日本物理学会(2020年)年次大会, オンライン開催, 2020/3/16-19

  • （国際学会）「BINDING MECHANISM OF ANTI-CANCER TARGET HSP90 AND PEPTIDE DRUG」,
    ◯Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita*, 64th Annual Meeting of the Biophysical Society, San Diego Convention Center San Diego, California, USA, 2020/2/15-19

  • (アウトリーチ活動・ 記事掲載)，濱口真慈, 『音楽の道を夢見た少女が、研究者として小さな分子の動きを表現する（あなたがあるく一歩さき）』, someone[サムワン], vol.49, 19, 2019

  • （招待講演）「コンピュータを使った創薬」,
    ◯松倉里紗, 『描け！掴め！君の未来の研究者像！ 〜のぞいてみよう大学のラボ〜』サイエンスキャッスル2019関西大会, 株式会社リバネス, 大阪明星学園明星中学校・明星高等学校（大阪市）,  2019/12/22

  • （アウトリーチ活動・ポスター審査員）, 松倉里紗, 『中高生のための学会』サイエンスキャッスル2019関西大会, 株式会社リバネス, 大阪明星学園明星中学校・明星高等学校（大阪市）,  2019/12/22

  • （国内学会）「新規ペプチド薬のHSP90との結合機構・機能阻害メカニズム」,
    ◯松倉 里紗, 望月和人, 宮下尚之*, 瀧真清, 渡辺信一, 第33回分子シミュレーション討論会, 名古屋市公会堂（名古屋）,  2019/12/9-11

  • （国内学会）「力学的安定性の高いモデル構造を生成するためのDeep Learning を用いたホモロジーモデリング」,
    ◯古江祐也, 松倉 里紗, 宮下尚之*, 第33回分子シミュレーション討論会, 名古屋市公会堂（名古屋）, 2019/12/9-11

  • （国内学会）「HSP90の分子動力学シミュレーションと新規中分子薬による機能阻害機構」,
    ◯Lisa Matsukura, Kazuto Mochizuki, Naoyuki Miyashita*, Masumi Taki, Shinichi Watanabe, 第42回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡(福岡), 2019/12/3-12/6

  • （国際学会・受賞🎉）「The Stability of a Stapled Peptide Drug and the Inhibition Mechanism of HSP90 Function using Long-time Molecular Dynamics Simulations」,
    ◯Lisa Matsukura, Kazuto Mochizuki, Naoyuki Miyashita*, Masumi Taki, Shinichi Watanabe, The 5th International Conference on Molecular Simulation, Lotte Hotel Jeju (Korea), 2019/11/3-6
    → ICMS2019 「The Best Poster Award」受賞 (https://www.kindai.ac.jp/bost/news/topics/2019/11/018529.html)

  • （国際学会）「Molecular Dynamics Simulations of CRISPR Type I-E System and the DNA binding Mechanisms」,
    ◯Naoyuki Miyashita*, Tomohiro Yamaguchi, Lisa Matsukura, Masaya Furue, The 5th International Conference on Molecular Simulation, Lotte Hotel Jeju (Korea), 2019/11/3-6

  • （国内学会）「The inhibition mechanism of HSP90 function by a medium molecular drug」,
    ◯Lisa Matsukura, Kazuto Mochizuki, Naoyuki Miyashita*, Masumi Taki, Shinichi Watanabe, CBI学会2019年大会, タワーホール船堀(東京), 2019/10/22-24

  • （国内学会）「Homology Modeling of the Protein Structure in the Solution using Deep Auto Encoder and Trajectories of the Long-time Molecular Dynamics Simulation of Template Proteins」,
    ◯Masaya Furue, Lisa Matsukura, Mitsutaka Nemoto, Naoyuki Miyashita, CBI学会2019年大会, タワーホール船堀(東京), 2019/10/22-24

  • （国際学会）「Molecular dynamics simulation of the biomolecules that related to the future biomedicine」,
    ◯Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita*, 11th symposium on Discovery, Fusion, Creation of New Knowledge by Multidisciplinary Computational Sciences, CCS International Symposium 2019, International Congress Center EPOCHAL TSUKUBA (Tsukuba), 2019/10/15

  • （学内発表）(招待講演) s5−4「新しい薬剤が切り開く健康への道〜スーパーコンピュータを使った新しい薬剤設計に向けて〜」,
    ◯松倉里紗,  望月和人, 宮下尚之*, 瀧真清, 渡辺信一, シンポジウムS5『科学と持続可能な社会〜SDGsの観点から〜』,  近畿大学大学院サイエンスネットワーク2019第9回院生サミット, 近畿大学東大阪キャンパス（東大阪）, 2019/10/5

  • （学内発表）P45「抗がん薬標的HSP90と新規中分子薬との結合機構の解明」,
    ◯松倉里紗, 望月和人, 宮下尚之*, 瀧真清, 渡辺信一, 近畿大学大学院サイエンスネットワーク2019第9回院生サミット, 近畿大学東大阪キャンパス（東大阪）, 2019/10/5

  • （国内学会）「Influence on the structure and dynamics of Riboswitch “SPINACH” and potassium ions by DFHBI」,
    ◯Lisa Matsukura,  Nobutaka Onishi, Masaya Furue, Naoyuki Miyashita*, Takuma Shiraki, Yasushige Yonezawa, 第57回日本生物物理学会年会, シーガイアコンベンションセンター(宮崎), 2019/9/24-26

  • （国内学会）「Development of Deep-Autoencoder based Homology Modeling software」,
    ◯Masaya Furue, Mitsutaka Nemoto, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 第57回日本生物物理学会年会, シーガイアコンベンションセンター(宮崎), 2019/9/24-26

  • （アウトリーチ活動）近畿大学オープンキャンパス（東大阪）BOSTワールド出展・ボランティア, 平成３２年度近畿大学オープンキャンパス, 近畿大学東大阪キャンパス（東大阪市），
    スタッフ：松倉・古江・山口・高見・土井・鈴木・久保・入梅・福田・南・松本・植田・小山内・清岡， 2019/9/22

  • （アウトリーチ活動）近畿大学生物理工学部オープンキャンパス（和歌山）・子ども科学担当・ボランティア, 平成３２年度近畿大学生物理工学部オープンキャンパス，近畿大学和歌山キャンパス（和歌山），
    スタッフ：宮下・松倉・柳野・久保・高見・土井・清宮・福田，2019/7/28

  • （国内学会）「Mechanism of the interaction between Hsp90 and the medium molecule drug, and the docking simulation」，
    ◯Lisa Matsukura, Kazuto Mochizuki, Masaya Furue, Masumi Taki, Naoyuki Miyashita, Shinichi Watanabe, 第19回 日本蛋白質科学会年会, 神戸国際会議場（神戸）, 2019/6/24-26

  • （国内学会）「Development of Homology modeling program using Deep Learning」，
    ◯Masaya Furue, Lisa Matsukura, Mitsutaka Nemoto, Naoyuki Miyashita, 第19回 日本蛋白質科学会年会, 神戸国際会議場（神戸）, 2019/6/24-26

  • （国内学会）「Dynamics of CRISPR Cas System」，
    ◯Naoyuki Miyashita, Yui Taketomo, Tomohiro Yamaguchi, Lisa Matsukura, Ryo Ohashi, 第19回 日本蛋白質科学会年会, 神戸国際会議場（神戸）, 2019/6/24-26

  • （国内学会）「中分子薬剤とHsp90との相互作用」，
    ○松倉里紗, 望月和人, 古江祐也, 宮下尚之*, 瀧真清, 渡辺信一, 第22回理論化学討論会, 北海道大学(学術交流会館), 2019/5/27-29

  • （競争的計算機資源・採択）松倉里紗，平成31年度TSUBAME若手・女性利用者支援制度，東京工業大学学術国際 情報センター ，採択，2019/4

• 2018年度

  • （成果発表会・受賞🎉）「分子シミュレーションを用いたHsp90と新規中分子薬の結合機構の提案」, 松倉里紗, 近畿大学生物理工学部, 2019/3/27→ 第５回生体システム工学専攻研究成果発表セミナー『最優秀発表賞』受賞

  • （国内学会・受賞🎉）「長時間MDシミュレーションを用いたHsp90と中分子薬の結合機構の提案」,
    ○松倉里紗, 望月和人, 古江祐也, 宮下尚之*, 瀧真清, 渡辺信一,  日本物理学会第74回年次大会、九州大学（福岡市）, 2019/3/15
    → 「日本物理学会学生優秀発表賞（Student Presentation Award of the Physical Society of Japan）」受賞，(https://www.kindai.ac.jp/bost/news/topics/2019/05/016691.html)

  • （成果発表会・受賞🎉）「分子シミュレーションとそのビッグデータ解析による新規中分子薬結合メカニズムの検討」,
    ○松倉里紗, 望月和人, 古江祐也, 宮下尚之*, 瀧真清, 渡辺信一,  平成31年度 和歌山大学システム工学部・近畿大学生物理工学部学生成果発表会（和歌山産業振興財団・和歌山情報サービス産業協会WAKASA）, ルミエール華月殿（和歌山市）, 2019/3/11
    → 平成31年度 和歌山大学システム工学部・近畿大学生物理工学部学生成果発表会（和歌山産業振興財団・和歌山情報サービス産業協会WAKASA）「最優秀賞」受賞，(https://www.kindai.ac.jp/bost/news/topics/2019/05/016691.html)

  • （アウトリーチ活動）研究室公開 for 台湾國立彰化女子高級中学, 宮下・松倉・古江・高橋, 2019/1/21

  • （アウトリーチ活動）研究室公開 for 和歌山信愛高等学校, 宮下・松倉・竹友・大多和・古江, 2018/11/8

  • （国内学会）「 Microsecond Molecular Dynamics Simulations of Medium Molecule Drugs and the docking with a target protein」,
    ○Lisa Matsukura, Kazuto Mochizuki, Masumi Taki, Shinichi Watanabe, Naoyuki Miyashita*, CBI学会2018年大会, タワーホール船堀（東京都）, 2018/10/9-11

  • （アウトリーチ活動）近畿大学東大阪キャンパスオープンキャンパス 体験イベント「シミュレーションによる生体分子顕微鏡ーコンピュータの中で揺らぐタンパク質を３Dで見るー」, 

  • スタッフ：高橋・古江・松倉・竹友・柳野・大多和・高見・土井・鈴木・久保・吉田久教授（宮下の代理）*，近畿大学東大阪キャンパス・ブロッサムカフェ２F（東大阪市）, 2018/9/23

  • （国内学会）「Dynamics of peptide aptamer which targeting Hsp90 and the development of supporting program for modification of force field parameters」,
    ○Lisa Matsukura, Kazuto Mochizuki, Masumi Taki, Naoyuki Miyashita*, Shinichi Watanabe, 日本生物物理学会第56回年会(岡山市), 2018/9/15-17

• 2017年度

  • （非公開セミナー）セミナー（発表者：松倉里紗（非公開））第４回近電セミナー, （オーガナイザー：宮下尚之, 渡辺信一[電通大], 瀧真清[電通大]）, 電気通信大学（調布市）, 2018/3/27

  • （学部長賞受賞🎉）近畿大学卒業式・学位授与式，近畿大学学部長賞受賞，松倉里紗，2018/3/19

  • （卒論発表・受賞🎉）「中分子創薬の分子シミュレーションと力場作成支援プログラムの開発」，
    ◯松倉里紗，近畿大学生物理工学部，2018/2/21
    → ベストプレゼンテーション賞受賞 ( Cグループ)

  • （研究会オーガナイザー）シンポジウム『HPCシステムを使った生命科学 ― 分子スケールから細胞に向けて ―』第１回近畿大学生物理工学部HPCシンポジウム, （オーガナイザー：宮下尚之, 木村裕一）, 近畿大学生物理工学部（紀の川市）, 2018/3/13,
    スタッフ：高橋・古江・ 大橋・松倉・山口

  • （アウトリーチ活動）推薦合格者入学前ガイダンス「研究室公開」,
    スタッフ：大橋燎, 松倉里紗, 山口知洋, 柳野賀緒梨, 宮下尚之 2018/1/21

  • （アウトリーチ活動）体験イベント 生物理工学部の世界『ナノサイズの生体分子の動きを３DやVRで見よう』,
    スタッフ：柳野・目・竹友・田中・野口・大橋・松倉・高橋・ 宮下，近畿大学東大阪キャンパス（大阪府東大阪市），2017/8/19

• 2016年度

  • （アウトリーチ活動）産官学交流会研究室公開，
    スタッフ：松倉・米満・古江・山口・大西・平野・大橋・木村・宮下．産官学交流会．紀の川市（近大和歌山キャンパス），2017/1/20

  • （アウトリーチ活動）出展：生命科学とコンピュータ，
    スタッフ：松倉・大橋・松井・竹内・高地・高橋・上野・梅田・宮下，近畿大学本部オープンキャンパス，東大阪市（本部キャンパス）．2016/7/24