FY2021-2023 科研費基盤研究（C)分担
血液凝固機能を阻害する非天然型DNAアプタマー薬剤の構造とヌクレアーゼ耐性機構
令和3(2021)年度 基盤研究(C)（一般）
研究代表者：渡辺 信一（電気通信大学・国際教育センター・特任教授）
分担
（学会発表・口頭）「共有結合型ペプチド薬剤とGST二量体との相互作用機構」,松倉里紗, 瀧真清, 宮下尚之, 渡辺信一, Jay Yang, 日本物理学会2023年春季大会, オンライン開催, 3/22-25, 2023
(国際学会・ポスター)『MOLECULAR DYNAMICS STUDY OF THE MECHANISM OF THE CLIENT UNFOLDED PROTEIN DELIVERY FROM HSP40 TO HSP70』, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, Biophysical Society Annual Meeting BPS2023, San Diego (USA), 2/18-22, 2023
（招待講演・ポスター）「分子動力学シミュレーションを用いたHSPシャペロンサイクルの解明と新規薬剤の作用機構」, 松倉里紗, 宮下尚之, ISSP Women's week 2022 物性女性若手研究交流会, 東京大学物性研究所, 11/15, 2022
（学会発表・ポスター）「Molecular dynamics study of the interaction between a GST dimer and a novel peptidic covalent aptamer」, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, Masumi Taki, Shinichi Watanabe, Jay Yang, CBI学会2022年大会, タワーホール船堀, 10/25-27, 2022
（学会発表・ポスター）「HSP40 binding affects the stability of HSP70」, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 第60回日本生物物理学会, 函館アリーナ・函館市民会館, 9/28-30, 2022
（学会発表・ポスター）「ペプチド型共有結合薬剤とGSTタンパク質との結合構造に関する分子動力学シミュレーション 」, 松倉里紗, 瀧真清，宮下尚之，渡辺信一，日本物理学会2022年秋季大会，東京工業大学，9/12-15, 2022
（査読あり・プロシーディング論文）"Simulation study of the function of domain swapping in the HSP90 chaperone cycle", L. Matsukura, and N. Miyashita, J. Phys.: Conf. Ser., 2207, 012024, (2022)（3月28日）
（学会発表・口頭）「HSP70のシャペロンサイクルにおける構造変化とコシャペロンとの相互作用の動力学」，松倉里紗，宮下尚之，日本物理学会第77回年次大会，オンライン開催，3/15-19, 2022
(査読あり・プロシーディング論文) "Simulation Study of the Stability of Heat Shock Protein 90 (HSP90) and Co-chaperone p23 Complex", Lisa MATSUKURA, Naoyuki MIYASHITA, Journal of Computer Chemistry, Japan, Volume 20 Issue 3, Pages 94-96, (2021) （12月11日）
（学会発表）“HSP70とHSP40の複合体のダイナミクスとHSP70のLidドメインの役割に関するシミュレーション”, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 第59回日本生物物理学会, オンライン開催, 11/25-27, 2021
（学会発表）「分子動力学シミュレーションを用いたHSP70のopen-close状態の違い」, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 日本物理学会2021年秋季大会, オンライン開催, 9/20-23, 2021
（学会発表）「ATP結合型と非結合型HSP70のダイナミクスの違い」, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 第15回分子科学討論会, オンライン開催, 9/18-21, 2021
（受賞・国際学会Best Poster Award）“Simulation study of the function of domain swapping in the HSP90 chaperone cycle", Lisa Matsukura, CCP2021
（国際学会発表）“Simulation study of the function of domain swapping in the HSP90 chaperone cycle", Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, CCP2021, 8/2-5, 2021
（学会発表）“The stability of HSP90NTD and ch-chaperone p23 by the domain swapping in HSP90 dimer”, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 第21回日本蛋白質科学会年会, オンライン開催, 6/16-18, 2021
(学会発表)「The Prediction of the Structure Changes of ADK along the Reaction Coordinate using Deep Neural Network and Molecular Dynamics Simulations.」, Ryota Kiyooka, Lisa Matsukura, Masaki Ottawa, Naoyuki Miyashita, 第21回日本蛋白質科学会, オンライン開催, 6/16-18, 2021
（受賞・奨学賞）『HSP90とコシャペロンの分子動力学シミュレーション』, 松倉里紗, 日本コンピュータ化学会
（学会発表）『HSP90とコシャペロンの分子動力学シミュレーション』, 松倉里紗, 宮下尚之, 日本コンピュータ化学会, オンライン開催, 6/5-6, 2021
（学会発表）『HSP90の分子動力学シミュレーションとドメインスワッピングの機能』, 松倉里紗, 宮下尚之, 第23回理論化学討論会, オンライン開催, 5/13-15, 2021