FY2014-2016 科研費基盤研究(C)の成果

膜タンパク質複合体予測の為の基盤ソフトウエア開発と疾患関連膜タンパク質への応用

文部科学省: 科学研究費補助金(基盤研究(C))

研究期間: 2014年 - 2016年 代表者: 宮下 尚之

Publications

• Papers
  1. Molecular dynamics simulations of biological membranes and membrane proteins using enhanced conformational sampling algorithms, Takaharu Mori, Naoyuki Miyashita, Wonpil Im, Michael Feig, Yuji Sugita, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes 1858(7) 1635-1651 2016年
  2. REIN: Replica-Exchange INterface for Simulating Protein Dynamics and Function, Naoyuki Miyashita, Suyon Re, Yugi Sugita, International Journal of Quantum Chemistry 115(5) 325-332 2015年3月
• Presentations
  • ①（ポスター）20aK-PS-52 ペプチドのリンカーによる構造揺らぎの制御, 松井直人, 古江祐也, 宮下尚之*, 瀧真清, 渡辺信一, 日本物理学会第72回年次大会, 2017年3月20日 大阪大学（大阪府豊中市）
  • ②（招待講演）アルツハイマー病の初期分子機構と分子シミュレーション〜治療薬創薬に向けて〜, 宮下尚之, 第２回認知症高齢者の生活の質向上のための学術的シンポジウム, 2017年3月1日 近畿大学（大阪府東大阪市）
  • ③（招待講演）生体分子シミュレーションと疾患機構〜アルツハイマー病とコレステロール〜, 宮下尚之, バイオメクフォーラム２１研究会 第８１回研究会, 大阪大学基礎工学部シグマホール, 2016年7月9日（大阪府豊中市）
  • ④（アウトリーチ・講演）ミクロの世界の認知症〜スーパーコンピュータを活用する〜, 宮下尚之, 平成２８年度第４回近畿大学生物理工学部公開講座、ホテルグランビア和歌山, 2016年6月25日（和歌山県和歌山市）
  • ⑤（招待講演） アルツハイマー病初期機構における脂質と鍵となる膜タンパク質の相互作用, 宮下尚之, 蛋白研セミナー『膜タンパク質の構造ダイナミクス』, 大阪大学蛋白質研究所（大阪府吹田市）, 2016年5月12-13日
  • ⑥（口頭発表）コレステロールのアミロイド前駆体タンパク質（APP）二量体形成機構への影響, 宮下尚之, 小串典子, 杉田有治, 日本物理学会 第71回年次大会（2016年）, 東北学院大学(宮城県仙台市) 2016年3月21日
  • ⑦（ポスター）コレステロールとアミロイド前駆体タンパク質APPの相互作用, 宮下尚之, 蛋白研セミナー 構造を基盤とする蛋白質科学における未解決問題, 東京大学先端科学研究センター（ENEOSホール）（東京都目黒区）, 2016年3月1日
  • ⑧（招待講演）アルツハイマー病の初期分子機構 ～コレステロールとアミロイド前駆体タンパク質の二量体化～, 宮下尚之, 蛋白研セミナー 構造を基盤とする蛋白質科学における未解決問題, 東京大学先端科学研究センター（ENEOSホール）（東京都目黒区）, 2016年3月1日
  • ⑨（招待講演）アルツハイマー病の初期分子機構と分子シミュレーション, 宮下尚之, 第6 回計算統計物理学研究会（年会）, 名古屋大学（愛知県名古屋市） 2015年11月21日
  • ⑩（ポスター）ガンやアルツハイマー病に関係する膜タンパク質の二量体構造予測とラフト環境における構造揺らぎ, 宮下尚之, ～スパコン「京」がひらく科学と社会～ 第2回「京」を中核とするHPCIシステム利用研究課題 成果報告会, 日本科学未来館（東京都江東区） 2015年10月26日
  • ⑪（招待講演）疾患プロセスの詳細を生体分子シミュレーションで理解する〜アルツハイマー病の初期過程〜, 宮下尚之, 私立大学戦略的研究基盤形成支援事業『地域・産学連携のためのライフイノベーション拠点形成』第1回成果評価会,近畿大学生物理工学部（和歌山県紀の川市） 2015年2月27日
  • ⑫（招待講演）脂質分子とアミロイド前駆体タンパク質（APP）との相互作用とダイナミクス, 宮下尚之, 神戸大学先端融合科学シンポジウム 『生体分子のダイナミクスを眺める』,神戸大学（兵庫県神戸市） 2015年1月19日
  • ⑬（招待講演）TSUBAMEを用いた生体分子シミュレーション研究, 宮下尚之, GTC Japan 2014 (nVidia社), 東京ミッドタウンホール 2014年7月14日（東京都港区）