Lisa Matsukura

がん病関連タンパク質のシミュレーションと新規中分子薬剤の研究、解析ソフトの開発

参加・発表など活動内容

  • 2021年度

    • 予定(国内学会The stability of HSP90NTD and ch-chaperone p23 by the domain swapping in HSP90 dimer,
      Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 第21回日本蛋白質科学会年会, オンライン開催, 2021/6/16-18


  • 2020年度

    • 予定(国内学会)The effect of the interaction between HSP90 and co-chaperone by novel HSP90 inhibitor,
      ◯Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 日本物理学会第76回年次大会(2021年), オンライン開催, 2021/3/12-15

    • 予定(国内学会)「生体膜中におけるAPPとα-/β-切断酵素との相互作用機構」,
      柳野賀緒梨,大多和克紀,松倉里紗,◯宮下尚之,日本物理学会第76回年次大会(2021年), オンライン開催, 2021/3/12-15

    • 予定(国内学会)モノアミン酸化酵素B(MAO-B)の薬剤結合部位のダイナミクスとPETトレーサーの結合,
      ◯大多和克紀, 松倉里紗, 宮下尚之, 原田龍一, 木村裕一, 古本祥三, 日本物理学会第76回年次大会(2021年), オンライン開催,
      2021/3/12-15

    • 予定(国際学会)DETAIL DYNAMICS AFTER ATP BINDING IN HSP90 CHAPERONE CYCLE AND THE EFFECT OF NOVEL PEPTIDE DRUG CANDIDATE USING MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS,
      ◯Lisa Matsukura,Naoyuki Miyashita*,65th Biophysical Society Annual Meeting BPS2021,オンライン開催,2021/2/22-26

    • (国内学会)分子シミュレーションを用いたHSP90機能阻害薬の作用機構の解明,
      ◯松倉里紗,宮下尚之*,瀧真清,第34回分子シミュレーション討論会,オンライン開催,
      2020/12/15

    • (国内学会)「MAO-Bのリガンド結合部の動力学とPET薬剤の結合自由エネルギー計算」,
      ◯大多和克紀, 松倉里紗, 宮下尚之, 原田龍一, 木村裕一, 古本祥三, 第34回分子シミュレーション討論会, オンライン開催,
      2020/12/15

    • (国内学会)「HSP90-NTD二量体におけるドメインスワッピングの機能」,
      ◯松倉里紗,瀧真清,渡辺信一,宮下尚之*,第43回日本分子生物学会年会,オンライン開催,2020/12/2-4

    • (国内学会)「PETトレーサーとMAO-B/タンパク質との薬剤結合」,
      ◯大多和克紀, 田中良奈, 松倉里紗, 宮下尚之, 原田龍一, 木村裕一, 古本祥三, 第43回日本分子生物学会年会, オンライン開催, 2020/12/2-4

    • (国際論文)Moderately-rigid and enthalpy-contributed cryptand-like library on bacteriophage T7: Design and selection of strong binder for cancer-related protein (Hsp90), Kazuto Mochizuki+, Lisa Matsukura+, Yuji Ito, Naoyuki Miyashita*, and Masumi Taki*, Organic & Biomolecular Chemistry, 19, 146-150, 2021, (+ : equiv contribution)

    • (国内学会・招待講演・シンポジウム)New Peptide Drug and the Molecular Dynamics Simulations of Target Protein and the New Drug .,
      ◯Lisa Matsukura,Naoyuki Miyashita*,Masumi Taki,Shinichi Watanabe, 第58回日本生物物理学会年会, オンライン開催, 2020/9/16-18

    • (国内学会)The dynamics of dopamine-regulated protein MAO-B in the mitochondrial membrane ,
      ◯MasakiOttawa, LisaMatsukura, NaoyukiMiyashita*, RyuichiHarada, YuichiKimura, SyozoFurumoto, 第58回日本生物物理学会年会, オンライン開催, 2020/9/16-18

    • (国内学会)HSP90二量体のシミュレーションと新規薬剤との相互作用1,
      ◯松倉里紗,宮下尚之*,瀧真清,渡辺信一,日本物理学会2020年秋季大会,オンライン開催,
      2020/9/8-11

    • (国内学会)生体膜環境下におけるMAO-Bの長時間分子動力学シミュレーションと薬剤結合
      ○大多和克紀,松倉里紗,柳野賀緒梨,宮下尚之*,原田龍一,木村裕一,古本祥三,日本物理学会2020年秋季大会,オンライン開催,
      2020/9/8-11

    • (国内学会)Molecular Dynamics Simulation of HSP90 Dimer and Docking Simulation of the Peptide Drug,
      ◯Lisa Matsukura,Naoyuki Miyashita*,Masumi Taki,Shinichi Watanabe
      , 第20回日本蛋白質科学会年会, オンライン開催, 2020/7/7-9

    • (国内学会)「Molecular Dynamics Simulations of Monoamine Oxidase B (MAO-B) and the drug binding,
      ◯Masaki Ottawa, Lisa Matsukura, Kaori Yanagino, Naoyuki Miyashita, Ryuichi Harada, Yuichi Kimura, Syozo Furumoto, 第20回日本蛋白質科学会年会, オンライン開催, 2020/7/7-9


  • 2019年度

    • (大学院部長賞受賞🎉近畿大学卒業式・学位授与式,近畿大学大学院部長賞受賞松倉 里紗, 2020/3/18

    • 国内学会ドッキングシミュレーションを用いたHSP90と中分子薬の結合機構,
      ◯松倉里紗,望月和人,宮下尚之*,瀧真清,渡辺信一, 第75回日本物理学会
      (2020)年次大会, オンライン開催, 2020/3/16-19

    • 国内学会粗視化モデルシミュレーションを用いたチロシンキナーゼの膜貫通部位のラフト中の二量体形成,
      ◯井本誓龍,南知香,柳野賀緒梨,松倉里紗,宮下尚之*, 第75回日本物理学会
      (2020)年次大会, オンライン開催, 2020/3/16-19

    • 国内学会学習データの自動選択法を取り入れたDeep Learningによる水溶液中タンパク質のホモロジーモデリング手法の開発,
      ◯古江 祐也,松倉里紗,大多和克紀, 宮下尚之*, 第75回日本物理学会
      (2020)年次大会, オンライン開催, 2020/3/16-19

    • 国内学会MAO-Bの長時間分子動力学シミュレーションによる薬剤結合部位の動力学解析,
      ◯大多和克紀,松倉里紗,田中良奈,柳野賀緒梨,宮下尚之*,木村裕一,古本祥三, 第75回日本物理学会
      (2020)年次大会, オンライン開催, 2020/3/16-19

    • (国際学会)「BINDING MECHANISM OF ANTI-CANCER TARGET HSP90 AND PEPTIDE DRUG」,
      ◯Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita*, 64th Annual Meeting of the Biophysical Society, San Diego Convention Center San Diego, California, USA, 2020/2/15-19

    • (アウトリーチ活動・ 記事掲載)濱口真慈, 『音楽の道を夢見た少女が、研究者として小さな分子の動きを表現する(あなたがあるく一歩さき)』, someone[サムワン], vol.49, 19, 2019

    • (招待講演)「コンピュータを使った創薬」,
      ◯松倉里紗, 『描け!掴め!君の未来の研究者像! 〜のぞいてみよう大学のラボ〜』サイエンスキャッスル2019関西大会, 株式会社リバネス, 大阪明星学園明星中学校・明星高等学校(大阪市), 2019/12/
      22

    • (アウトリーチ活動・ポスター審査員), 松倉里紗, 『中高生のための学会』サイエンスキャッスル2019関西大会, 株式会社リバネス, 大阪明星学園明星中学校・明星高等学校(大阪市), 2019/12/22

    • 国内学会)「新規ペプチド薬のHSP90との結合機構・機能阻害メカニズム」,
      ◯松倉 里紗, 望月和人, 宮下尚之*, 瀧真清, 渡辺信一, 第33回分子シミュレーション討論会, 名古屋市公会堂(名古屋), 2019/12/9-11

    • 国内学会)「力学的安定性の高いモデル構造を生成するためのDeep Learning を用いたホモロジーモデリング」,
      ◯古江祐也, 松倉 里紗, 宮下尚之*, 第33回分子シミュレーション討論会, 名古屋市公会堂(名古屋), 2019/12/9-11

    • 国内学会)「HSP90の分子動力学シミュレーションと新規中分子薬による機能阻害機構」,
      ◯Lisa Matsukura, Kazuto Mochizuki, Naoyuki Miyashita*, Masumi Taki, Shinichi Watanabe, 第42回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡(福岡), 2019/12/3-12/6

    • (国際学会・受賞🎉)「The Stability of a Stapled Peptide Drug and the Inhibition Mechanism of HSP90 Function using Long-time Molecular Dynamics Simulations」,
      ◯Lisa Matsukura, Kazuto Mochizuki, Naoyuki Miyashita*, Masumi Taki, Shinichi Watanabe, The 5th International Conference on Molecular Simulation, Lotte Hotel Jeju (Korea), 2019/11/3-6

      ICMS2019 「The Best Poster Award受賞 (https://www.kindai.ac.jp/bost/news/topics/2019/11/018529.html)

    • (国際学会)「Molecular Dynamics Simulations of CRISPR Type I-E System and the DNA binding Mechanisms」,
      ◯Naoyuki Miyashita*, Tomohiro Yamaguchi, Lisa Matsukura, Masaya Furue, The 5th International Conference on Molecular Simulation, Lotte Hotel Jeju (Korea), 2019/11/3-6

    • 国内学会)「The inhibition mechanism of HSP90 function by a medium molecular drug」,
      ◯Lisa Matsukura, Kazuto Mochizuki, Naoyuki Miyashita*, Masumi Taki, Shinichi Watanabe, CBI学会2019年大会, タワーホール船堀(東京), 2019/10/22-24

    • 国内学会)「Homology Modeling of the Protein Structure in the Solution using Deep Auto Encoder and Trajectories of the Long-time Molecular Dynamics Simulation of Template Proteins」,
      ◯Masaya Furue, Lisa Matsukura, Mitsutaka Nemoto, Naoyuki Miyashita, CBI学会2019年大会, タワーホール船堀(東京), 2019/10/22-24

    • (国際学会)「Molecular dynamics simulation of the biomolecules that related to the future biomedicine」,
      ◯Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita*, 11th symposium on Discovery, Fusion, Creation of New Knowledge by Multidisciplinary Computational Sciences, CCS International Symposium 2019, International Congress Center EPOCHAL TSUKUBA (Tsukuba), 2019/10/15

    • (学内発表)(招待講演) s5−4「新しい薬剤が切り開く健康への道〜スーパーコンピュータを使った新しい薬剤設計に向けて〜」,
      ◯松倉里紗, 望月和人, 宮下尚之*, 瀧真清, 渡辺信一, シンポジウムS5『科学と持続可能な社会〜SDGsの観点から〜』, 近畿大学大学院サイエンスネットワーク2019第9回院生サミット, 近畿大学東大阪キャンパス(東大阪), 2019
      /10/5

    • (学内発表)P45「抗がん薬標的HSP90と新規中分子薬との結合機構の解明」,
      ◯松倉里紗, 望月和人, 宮下尚之*, 瀧真清, 渡辺信一, 近畿大学大学院サイエンスネットワーク2019第9回院生サミット, 近畿大学東大阪キャンパス(東大阪), 2019
      /10/5

    • 国内学会)「Influence on the structure and dynamics of Riboswitch “SPINACH” and potassium ions by DFHBI」,
      ◯Lisa Matsukura, Nobutaka Onishi, Masaya Furue, Naoyuki Miyashita*, Takuma Shiraki, Yasushige Yonezawa, 第57回日本生物物理学会年会, シーガイアコンベンションセンター(宮崎), 2019
      /9/24-26

    • 国内学会)「Development of Deep-Autoencoder based Homology Modeling software,
      ◯Masaya Furue, Mitsutaka Nemoto, Lisa Matsukura, Naoyuki Miyashita, 第57回日本生物物理学会年会, シーガイアコンベンションセンター(宮崎), 2019/9/24-26

    • (アウトリーチ活動)近畿大学オープンキャンパス(東大阪)BOSTワールド出展・ボランティア, 平成32年度近畿大学オープンキャンパス, 近畿大学東大阪キャンパス(東大阪市)
      スタッフ:松倉古江山口高見土井鈴木久保入梅福田松本植田小山内清岡 2019/9/22

    • (アウトリーチ活動)近畿大学生物理工学部オープンキャンパス(和歌山)・子ども科学担当・ボランティア, 平成32年度近畿大学生物理工学部オープンキャンパス近畿大学和歌山キャンパス(和歌山)
      スタッフ:宮下・松倉・柳野・久保・高見・土井・清宮・福田,2019/7/28

    • 国内学会)「Mechanism of the interaction between Hsp90 and the medium molecule drug, and the docking simulation」
      Lisa Matsukura, Kazuto Mochizuki, Masaya Furue, Masumi Taki, Naoyuki Miyashita, Shinichi Watanabe, 第19回 日本蛋白質科学会年会, 神戸国際会議場(神戸), 2019/6/24-26

    • 国内学会)「Development of Homology modeling program using Deep Learning」
      Masaya Furue, Lisa Matsukura, Mitsutaka Nemoto, Naoyuki Miyashita, 第19回 日本蛋白質科学会年会, 神戸国際会議場(神戸), 2019/6/24-26

    • 国内学会)「Dynamics of CRISPR Cas System」
      Naoyuki Miyashita, Yui Taketomo, Tomohiro Yamaguchi, Lisa Matsukura, Ryo Ohashi, 第19回 日本蛋白質科学会年会, 神戸国際会議場(神戸), 2019/6/24-26

    • 国内学会)「中分子薬剤とHsp90との相互作用」
      ○松倉里紗, 望月和人, 古江祐也, 宮下尚之*, 瀧真清, 渡辺信一, 第22回理論化学討論会, 北海道大学(学術交流会館), 2019/5/27-29

    • (競争的計算機資源・採択)松倉里紗,平成31年度TSUBAME若手・女性利用者支援制度,東京工業大学学術国際 情報センター ,採択,2019/4


  • 2018年度

    • (成果発表会・受賞🎉)「分子シミュレーションを用いたHsp90と新規中分子薬の結合機構の提案」, 松倉里紗, 近畿大学生物理工学部, 2019/3/27→ 第5回生体システム工学専攻研究成果発表セミナー『最優秀発表賞』受賞

    • 国内学会・受賞🎉)「長時間MDシミュレーションを用いたHsp90と中分子薬の結合機構の提案」,
      ○松倉里紗, 望月和人, 古江祐也, 宮下尚之*, 瀧真清, 渡辺信一, 日本物理学会第74回年次大会、九州大学(福岡市), 2019/3/15
      「日本物理学会学生優秀発表賞(Student Presentation Award of the Physical Society of Japan)」受賞,(https://www.kindai.ac.jp/bost/news/topics/2019/05/016691.html)

    • (成果発表会・受賞🎉)「分子シミュレーションとそのビッグデータ解析による新規中分子薬結合メカニズムの検討」,
      ○松倉里紗, 望月和人, 古江祐也, 宮下尚之*, 瀧真清, 渡辺信一, 平成31年度 和歌山大学システム工学部・近畿大学生物理工学部学生成果発表会(和歌山産業振興財団・和歌山情報サービス産業協会WAKASA), ルミエール華月殿(和歌山市), 2019/3/11
      平成31年度 和歌山大学システム工学部・近畿大学生物理工学部学生成果発表会(和歌山産業振興財団・和歌山情報サービス産業協会WAKASA)「最優秀賞」受賞,(https://www.kindai.ac.jp/bost/news/topics/2019/05/016691.html)

    • (アウトリーチ活動)研究室公開 for 台湾國立彰化女子高級中学, 宮下・松倉・古江・高橋, 2019/1/21

    • アウトリーチ活動)研究室公開 for 和歌山信愛高等学校, 宮下・松倉・竹友・大多和・古江, 2018/11/8

    • 国内学会)「 Microsecond Molecular Dynamics Simulations of Medium Molecule Drugs and the docking with a target protein」,
      ○Lisa Matsukura, Kazuto Mochizuki, Masumi Taki, Shinichi Watanabe, Naoyuki Miyashita*, CBI学会2018年大会, タワーホール船堀(東京都), 2018/10/9-11

    • (アウトリーチ活動)近畿大学東大阪キャンパスオープンキャンパス 体験イベント「シミュレーションによる生体分子顕微鏡ーコンピュータの中で揺らぐタンパク質を3Dで見るー」,

    • スタッフ:高橋・古江・松倉・竹友・柳野・大多和・高見・土井・鈴木・久保・吉田久教授(宮下の代理)*,近畿大学東大阪キャンパス・ブロッサムカフェ2F(東大阪市), 2018/9/23

    • 国内学会)「Dynamics of peptide aptamer which targeting Hsp90 and the development of supporting program for modification of force field parameters」,
      ○Lisa Matsukura, Kazuto Mochizuki, Masumi Taki, Naoyuki Miyashita*, Shinichi Watanabe, 日本生物物理学会第56回年会(岡山市), 2018/9/15-17


  • 2017年度

    • (非公開セミナー)セミナー(発表者:松倉里紗(非公開))第4回近電セミナー, (オーガナイザー:宮下尚之, 渡辺信一[電通大], 瀧真清[電通大]), 電気通信大学(調布市), 2018/3/27

    • (学部長賞受賞🎉)近畿大学卒業式・学位授与式近畿大学部長賞受賞,松倉里紗,2018/3/19

    • (卒論発表・受賞🎉)「中分子創薬の分子シミュレーションと力場作成支援プログラムの開発」
      松倉里紗,近畿大学生物理工学部,2018/2/21
      ベストプレゼンテーション賞受賞 ( Cグループ)

    • (研究会オーガナイザー)シンポジウム『HPCシステムを使った生命科学 ― 分子スケールから細胞に向けて ―』第1回近畿大学生物理工学部HPCシンポジウム, (オーガナイザー:宮下尚之, 木村裕一), 近畿大学生物理工学部(紀の川市), 2018/3/13,
      スタッフ:高橋・古江・ 大橋・松倉・山口

    • (アウトリーチ活動)推薦合格者入学前ガイダンス「研究室公開」,
      スタッフ:大
      橋燎, 松倉里紗, 山口知洋, 柳野賀緒梨, 宮下尚之 2018/1/21

    • (アウトリーチ活動)体験イベント 生物理工学部の世界『ナノサイズの生体分子の動きを3DやVRで見よう』,
      スタッフ:柳野・目・竹友・田中・野口・大橋・松倉・高橋・ 宮下,近畿大学東大阪キャンパス(大阪府東大阪市),2017/8/19


  • 2016年度

    • (アウトリーチ活動)産官学交流会研究室公開,
      スタッフ:
      松倉・米満・古江・山口・大西・平野・大橋・木村・宮下.産官学交流会.紀の川市(近大和歌山キャンパス),2017/1/20

    • (アウトリーチ活動)出展:生命科学とコンピュータ
      スタッフ:松倉・大橋・松井・竹内・高地・高橋・上野・梅田・宮下,近畿大学本部オープンキャンパス,東大阪市(本部キャンパス).2016/7/24